反渗透（RO）系统的行为类似于锅炉或冷却塔，因为它们会使补充水中的溶解盐分变得更浓。当纯净水渗透到RO膜中时，盐会以浓缩流的形式留在后面。如果超过任何特定盐的溶解度，则存在盐将直接在膜表面上或可能在通过膜元件的流道内形成水垢的可能性。

这种水垢的形成将首先发生在反渗透系统的尾端，在水以其浓缩液流离开系统之前，水流过的最后元素内。结垢将导致反渗透系统需要增加压力才能达到相同的渗透流率，并且渗透率在系统尾端可能会增加。恢复性能将需要使用酸性溶液进行清洁，尽管膜清洁仅在某些类型的水垢上有效。对于二氧化硅垢或大多数硫酸盐，它不可能完全有效。如果清洗无法恢复性能，则更换膜将成为恢复失去的RO性能的唯一选择。

对于大多数水源而言，防止水垢的形成不一定是难题。通常可以通过将以下三个选项中的一个或多个应用于反渗透进料流来完成：

酸注入

水软化

注入阻垢剂

可以使用美国水的阻垢剂投影计划（SIPP）来预测水的具体需求，该计划考虑了水的特殊组成，水温和pH值以及相对于所需盐分的盐分浓度因子渗透反渗透系统。正确的方法通常取决于应用程序的优先级。

酸注入可有效防止碳酸钙结垢，但对防止硫酸盐或二氧化硅结垢仅有一点作用。酸注入在许多应用中的主要缺点是会导致形成二氧化碳，而二氧化碳很容易渗透到RO膜中。然后可能给下游离子交换或脱气设备带来去除负担。

石灰的软化作用会降低水的硬度，碱度和溶解的二氧化硅，以至于RO装置可能能够在低渗透物回收率的情况下运行，并减少水垢的形成。但是，要充分利用反渗透进料压力提高渗透物回收率并最大程度地减少水的浪费，就需要将水的硬度大大降低。然后，这将需要对RO进料水进行沸石软化，这需要使用一种强酸阳离子交换树脂，该树脂通过氯化钠进行再生。这种方法的优势在于，它可以将苛性碱（氢氧化钠）注入反渗透系统的上游，以提高其进水的pH值，这将导致碱度，溶解的二氧化硅和硼的去除率增加。在升高的pH值下操作也将减少形成氧化硅垢的可能性。

防止结垢的最经济有效的方法（如果适用）是注入阻垢剂。使用与锅炉和冷却塔中使用的防垢剂相似的化学物质，可以充分减缓水垢晶体的形成，以使这些晶体以其精矿流离开RO系统。以这种方式，只要RO系统正在运行，就可以安全地超过碳酸钙和硫酸盐的饱和点。当RO单元关闭时，至关重要的是使用渗透水或通过允许低压给水置换系统中滞留的水来冲洗系统中的过饱和盐。

反渗透工业早期使用的一些阻垢产品由单一聚合物组成，当注入某些水源（例如含铁的水）时，该聚合物往往会失去其溶解度。这将导致RO预滤器滤芯以及膜元件严重结垢。

诸如博能反渗透专用阻垢剂之类的产品是既包含聚合物又包含膦酸酯的共混产品，可用于反渗透系统。它们协同工作以提高溶解度，同时提供出色的防垢能力。实际上，它们还将帮助使铁保持悬浮状态，以减少铁对反渗透系统的污染。可以使用SIPP程序确定适当的剂量。

通过正确使用所选的防垢方法，大多数反渗透系统将永远不必经历水垢形成的过程。